| 1 | Martin Zlámalík (Cze) KDL Trans-Landbouwkrediet | 1:04:14 |
| 2 | Petr Dlask (Cze) Rubena Birell Specialized | 0:00:01 |
| 3 | Zdenek Mlynár (Cze) Focus Cycling Znojmo | 0:00:14 |
| 4 | David Kášek (Cze) Cyklo Team Tábor | 0:00:22 |
| 5 | Lubomír Petruš (Cze) KC Hlinsko | 0:00:33 |
| 6 | Vladimír Kyzivát (Cze) Johnson Controls TJ Auto Škoda | 0:00:58 |
| 7 | Jan Denuwelaere (Bel) Style and Concept | 0:01:02 |
| 8 | Jan Nesvadba (Cze) Madeta - Fitness / Specialized | |
| 9 | Filip Eberl (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:01:10 |
| 10 | Michael Boroš (Cze) Cyklo Team Tábor | 0:01:17 |
| 11 | Tomáš Paprstka (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:01:20 |
| 12 | Milan Spešný (Cze) S&H Superior Mtb Team | 0:01:21 |
| 13 | Jan Škarnitzl (Cze) Rubena Birell Specialized | 0:01:34 |
| 14 | Marek Rauchfuss (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:01:37 |
| 15 | Christoph Pfingsten (Ger) Cyclingteam de Rijke | 0:01:51 |
| 16 | Robert Gavenda (Svk) KDL Trans-Landbouwkrediet | 0:02:13 |
| 17 | Jakub Skála (Cze) Cyklo Team Tábor | 0:02:23 |
| 18 | Ondrej Cink (Cze) Merida Biking Team | 0:02:33 |
| 19 | Pavel Adel (Cze) KC Hlinsko | 0:02:52 |
| 20 | Radek Polnický (Cze) Empella Czech Team | 0:03:12 |
| 21 | Robert Glajza (Svk) CK Banská Bystrica | 0:03:26 |
| 22 | Tomáš Medek (Cze) Madeta - Fitness / Specialized | 0:03:33 |
| 23 | Filip Adel (Cze) CK MTB Maraton Hlinsko | 0:03:39 |
| 24 | Václav Metlicka (Svk) Johnson Controls TJ Auto Škoda | 0:03:43 |
| 25 | Martin Haring (Svk) CK Banská Bystrica | 0:03:50 |
| 26 | Matej Lasák (Cze) MAX CURSOR | 0:03:51 |
| 27 | Vojtech Nipl (Cze) TJ Stadion Louny | 0:03:52 |
| 28 | Ivo Plevák (Cze) MAX CURSOR | 0:04:04 |
| 29 | Lukáš Sáblík (Cze) KC Kooperativa Sg Jablonec N.N | 0:04:46 |
| 30 (-1 lap) | Michal Benda (Cze) TJ Sokol Plavy-Cyklo Benda | |
| 31 | Tomáš Podrazil (Cze) TJ Sokol Holé Vrchy | |
| 32 (-2 laps) | Radim Kovár (Cze) Moravec-Merida Czech Mtb Team | |
| 33 | Tomáš Svoboda (Cze) Madeta - Fitness / Specialized | |
| 34 | Tomáš Bohata (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | |
| 35 | Josef Soukup (Cze) Focus Cycling Znojmo | |
| 36 (-3 laps) | Michal Malík (Cze) KC Kooperativa SG Jablonec N.N | |
| 37 | Jirí Polnický (Cze) Sunweb - Revor Team | |
| 38 | Tomáš Barták (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | |
| 39 | Adam Kožušník (Cze) CK Feso Petrvald | |
| 40 (-4 laps) | Stanislav Bambula (Cze) Cyklo Team Tábor | |
| 41 | Tomáš Janošek (Cze) ACK Stará Ves n. Ondrejnicí | |
| 42 (-5 laps) | Lukas Stoiber (Aut) Die NO Rad Union | |
| 43 | Roland Mörx (Aut) ARBÖ Radsport Kiesl | |
| 44 | Ondrej Louvar (Cze) KC Hlinsko | |
| 45 (-6 laps) | Jan Kec (Cze) Superior Riders | |
| 46 | David Kasper (Cze) CT J.Hradec U SK Kamen | |
| 47 | Michael Kubín (Cze) Johnson Controls TJ Auto Škoda | |
| 48 | Jan Svoboda (Cze) Yogi Racing Ostrava | |
| 49 | Zbynek Holubovský (Cze) Galaxy Cyklošvec | |
| 50 (-7 laps) | Jakub Truksa (Cze) Atom Bike Trek Team | |
| 51 | Tomáš Holický (Cze) CK Rbb Invest A.S. | |
| 52 | Marek Sedlácek (Cze) S.K. Jirí Team Ostrava | |
| 53 | Václav Svatoš (Cze) TJ Sokol Holé Vrchy | |
| 54 (-8 laps) | Josef Tomek (Cze) Kolík TJ Bohumín | |
| 55 | Tomáš Frydrych (Cze) Johnson Controls TJ Auto Škoda | |
