| 1 | Christoph Pfingsten (Ger) Cyclingteam de Rijke | 1:03:49 |
| 2 | Vladimír Kyzivát (Cze) Johnson Controls TJ Auto | 0:00:06 |
| 3 | Tomáš Paprstka (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:00:18 |
| 4 | David Kášek (Cze) Cyklo Team Tábor | 0:00:58 |
| 5 | Vojtech Nipl (Cze) TJ Stadion Louny | 0:01:01 |
| 6 | Lubomír Petruš (Cze) KC Hlinsko | 0:01:03 |
| 7 | Michael Boroš (Cze) Cyklo Team Tábor | |
| 8 | Radek Polnický (Cze) Empella Czech Team | 0:01:08 |
| 9 | Zdenek Mlynár (Cze) FOCUS CYCLING ZNOJMO | 0:02:07 |
| 10 | Jakub Skála (Cze) Cyklo Team Tábor | 0:02:27 |
| 11 | Václav Metlicka (Svk) Johnson Controls TJ Auto | 0:02:32 |
| 12 | Tomáš Bohata (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:02:36 |
| 13 | Toni Bretschneider (Ger) Velo-Club Rheinhessen | 0:02:37 |
| 14 | Filip Eberl (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | 0:02:38 |
| 15 | Václav Ježek (Cze) ALPINE PRO - AUTHOR TEAM | 0:02:49 |
| 16 | Ivo Plevák (Cze) MAX CURSOR | 0:02:51 |
| 17 | Lukáš Sáblík (Cze) KC KOOPERATIVA SG | 0:02:55 |
| 18 | Michal Malík (Cze) KC KOOPERATIVA SG | 0:02:56 |
| 19 | Petr Hampl (Cze) KC Hlinsko | 0:02:57 |
| 20 | Karel Nepraš (Cze) ACK Stará Ves n. Ondrejnicí | 0:03:15 |
| 21 | Filip Adel (Cze) CK MTB Maraton Hlinsko | 0:03:53 |
| 22 | Robert Glajza (Svk) CK Banská Bystrica | 0:04:07 |
| 23 | Josef Soukup (Cze) Focus Cycling Znojmo | 0:04:12 |
| 24 | Martin Haring (Svk) CK Banská Bystrica | 0:04:23 |
| 25 | Adam Kožušník (Cze) CK Feso Petrvald | 0:04:37 |
| 26 | Konrad Opitz (Ger) Svg. Zehlendorfer Eichhörnchen | 0:05:00 |
| 27 | Michal Benda (Cze) TJ Sokol Plavy-Cyklo Benda | 0:05:19 |
| 28 | Matej Lasák (Cze) MAX CURSOR | 0:05:31 |
| 29 (-2 laps) | Tomáš Janošek (Cze) ACK Stará Ves n. Ondrejnicí | |
| 30 | Michael Kubín (Cze) Johnson Controls TJ Auto | |
| 31 | Tomáš Svoboda (Cze) Madeta - Fitness / Specialized | |
| 32 (-3 laps) | Tomáš Podrazil (Cze) TJ Sokol Holé Vrchy | |
| 33 | Tomáš Barták (Cze) Remerx Cycling Team Kolín | |
| 34 (-4 laps) | Marek Michalec (Svk) Olympik Trnava | |
| 35 | Tomáš Medek (Cze) Madeta - Fitness / Specialized | |
| 36 (-5 laps) | Jirí Šlégl (Cze) Johnson Controls TJ Auto | |
| 37 | Václav Viktorín (Cze) CK Team Bike Brezová | |
| 38 | Jan - Manntz (Ger) Svg. Zehlendorfer Eichhörnchen | |
| 39 | Josef Tomek (Cze) Kolík TJ Bohumín | |
| 40 | Václav Svatoš (Cze) TJ Sokol Holé Vrchy | |
| 41 | Roland Mörx (Aut) ARBÖ Radsport Kiesl | |
| 42 (-6 laps) | Jan Kec (Cze) Superior Riders | |
| 43 | Holubovský (Cze) GALAXY CYKLOŠVEC | |
| 44 | Jakub Truksa (Cze) Atom Bike Trek Team | |
| 45 | Tomáš Nový (Cze) Cyklo Team Tábor | |
| 46 | Marek Sedlácek (Cze) S.K. Jirí Team Ostrava | |
| 47 | Tomáš Holický (Cze) CK Rbb Invest A.S. | |
| 48 | Václav Aška (Cze) KONA CYCLING POINT | |
