| 1 | Johannes Sickmüller (Ger) Stevens Cyclocross Team Hamburg | 1:00:43 |
| 2 | Ole Quast (Ger) Stevens Cyclocross Team Hamburg | 0:00:08 |
| 3 | Christoph Pfingsten (Ger) KED Bianchi Berlin | 0:00:55 |
| 4 | Finn Heitmann (Ger) Team Focus-Alpecin Cross | 0:01:17 |
| 5 | Konrad Michael Optiz (Ger) | 0:01:45 |
| 6 | Karsten Volkmann (Ger) Team Isaac Torgau | 0:02:05 |
| 7 | Fabian Danner (Ger) Rad-Union 191 | 0:02:15 |
| 8 | Petr Cirkl (Cze) | 0:02:40 |
| 9 | Michael Schweizer Jr. (Ger) | |
| 10 | Stefan Freudenberg (Ger) Dresdner SC 189 | |
| 11 | Sven Kuschla (Ger) Cyclo-Cross-Team Team Roseversand | |
| 12 | Sandro Kuhmel (Ger) | |
| 13 | Christian Schneidawind (Ger) | 0:02:48 |
| 14 | David Bertram (Ger) RIG Saarbrücken | 0:03:28 |
| 15 | Roman Sedlmeier (Ger) | 0:03:33 |
| 16 | Hannes Genze (Ger) Multivan Merida Biking Team | 0:03:43 |
| 17 | Torsten Wittig-Kupfernagel (Ger) | 0:03:53 |
| 18 | Christoph Ambroziak (Ger) RSC 198 | 0:04:20 |
| 19 | Tomasz Skrzypek (Pol) MTB Verein Berlin | 0:04:38 |
| 20 | Toni Bretschneider (Ger) | 0:05:12 |
| 21 | Marcel Seidel (Ger) Hallenradsportverein Chemnitz | 0:05:23 |
| 22 | Phil Herbst (Ger) Team Focus-Alpecin Cross | 0:06:28 |
| 23 | Christopher Maletz (Ger) White Rock | |
| 24 | Mirko Volk (Ger) Berner-Bikes.com | |
| 25 | Florian Bodenschatz (Ger) SC DHfK Leipzig e.V. | |
| 26 | Christoph Altenkirch (Ger) | |
| 27 | Thomas Lechermann (Ger) | |
| 28 | René Heinze (Ger) | |
| 29 | Florian Fahr (Ger) | |
| 30 | Steffen Wolfram (Ger) Hallenradsportverein Chemnitz | |
| 31 | Phillipp Rothe (Ger) | |
| 32 | Stefan Stork (Ger) VC 188 | |
